Sonic era um dos muitos moradores da Ilha do Sul quando Eggman a invadiu a fim de construir seu exército de robôs. Mas Sonic possuía um dom especial: sua velocidade era maior do que a velocidade do som e conseguiu escapar das garras do gorducho. Daquele momento em diante, Sonic imcubiu-se da missão de resgatar seus amigos de Eggman e libertar a Ilha do Sul. Ao longo do caminho, Sonic se deparou com muitos segredos, inclusive de que ele seria a chave de uma profecia, do qual libertaria Mobius e suas terras para sempre do mal.

Dr. Ivo Robotinik, ou Eggman, recebeu esse nome devido ao seu corpo forte e torneado em formato de ovo. Verdadeiro gênio do mal, obcecado pelo poder, vive desafiando Sonic com sua avançada tecnologia e seu principal objetivo é capturar as Chaos Emeralds e, tendo fonte de poder ilimitado, criar seu império de robôs, escravizando os animais da floresta. Sonic sempre foi um calo no pé magrelo de Eggman, e analisando e muito o seu inimigo, do alto de sua base de operações, o Death Egg, já criou diversas engenhocas para vencer o ouriço, mas Sonic sempre acaba sendo mais rápido e astuto.

Miles Prower é uma raposa (mas mui macho!) de duas caudas que sempre foi fã de Sonic. Devido à sua particularidade, os animais da floresta lhe apelidaram de Tails. O pequenino também é muito rapido, e sempre tenta acompanhar Sonic, mas só de exibido, Sonic dispara na frete, deixando a jovem raposa para trás. Mas Tails não desiste e continua acompanhando o seu herói voando, utilizando suas duas caudas em forma de hélice. Tails também é um pequeno prodigio em mecanica, e construiu o avião Tornado que ajudou Sonic no segundo game. Sonic o considera um grande amigo e um irmãozinho menor.

Até mesmo o pequeno Tails já teve contato com as Super Emeralds, tornando-se rápido como a luz. Seu corpo fica de uma cor dourada muito leve e brilhante, seu vôo, mais veloz. Em sua forma Super, inexplicavelmente, Tails recebe a ajuda de pássaros que rodeiam o seu corpo, protegendo-o. Suponha-se que sejam os lendários Flicks, aves místicas.

Na verdade esse é um personagem inexistente da saga, pois ele se trata apenas de um bug no jogo Sonic the Hedgehog 2. Mas tamanha popularidade do bug, que acabou virando personagem real para os fãs, que lhe colocaram o nome de Ashura.

Com o poder das Chaos Emeralds, Sonic pode se transformar em Super Sonic, ganhando enorme poder, podendo voar, correr ainda mais rápido e usar os super pulos. Um curiosidade é que, dizem boatos, Super Sonic foi uma idéia retirada do anime Dragon Ball Z, no qual o personagem principal Goku, também fica com os cabelos louros e espetados, enquanto as Chaos Emeralds seriam uma alusão às Esferas do Dragão. Boatos...

Em meio aos acontecimentos na Angel Island, Sonic acaba descobrindo os segredos do verdadeiro poder das Super Emeralds. Ao Sonic entrar em contato com esses novas forças, ele se torna Hyper Sonic, com um poder muito maior do que na forma Super; seu corpo se torna brilhante com as cores das esmeraldas e seu poderoso ataque sônico agora se torna mais destrutivo: o Homing Attack, um ataque área que dispara raios a sua volta.

Este clone robótico de Sonic teve uma rápida aparição em Sonic 2, sendo sub-chefe antes do confronto final do jogo. Eggman tratou de desenvolver um clone robusto, forte e imponente e o manteve como sentinela em sua base espacial Death Egg. Mas esse robô não recebeu inteligencia suficiente, obedecendo somente ordens básicas. Para desepero de Eggman, Silver Sonic foi vencido facilmente.

Amiga e admiradora de Sonic, Amy faz uma participação rápida em Sonic CD. Segundo o enredo original, Amy é a primeira a encontrar Sonic antes dele viajar até Little Planet. É raptada por Metal Sonic e mantida refém por Eggman até o final do jogo.

Metal Sonic foi uma dor de cabeça grande para o ouriço: sua velocidade é próxima da de Sonic, seu corpo pode arder em eletricidade enquanto ataca em forma de torpedo e ainda pode voar. Em Sonic CD, Metal Sonic sequestra Amy e a leva à Eggman, que a mantem como prisioneira. Enquanto Eggman se ocupava dos planos, Metal Sonic agia como espião e caçador, sequestrando as criaturas de Little Planet. Muitos disseram que Metal Sonic era visto em muitas partes, quase que ao mesmo tempo.

Knuckles é descendente da dinastia das Echdinas de Mobius, que sempre guardaram a Master Emerald, responsável por manter a Angel Island nos céus, dentro da no Hidden Palace. Knux possui temperamento forte e explosivo; ele tira proveito de seus punhos com garras afaiadas para atacar os seus inimigos. Porém, ele facilmente é iludido por Eggman, acreditando que Sonic seria o ladrão das Esmeraldas, e devido a isso, Knuckles sempre atrapalhou Sonic pelo caminho. Depois de muitas águas rolarem, Knuckles finalmente enxergou quem era o vilão da história, num desfecho dentro da Hidden Palace.

A missão sagrada de Knuckles de proteger a Master Emeralds fez com que ele entrasse em contato com as Chaos Emeralds, tornando-se Super Knuckles. Seu corpo fica levemente coberto por uma pele prateada e seu vôo se torna mais rápido.

No momento em que Knuckles utiliza o poder das Super Emeralds, sem outra alternativa para proteger a Master Emerald dos inimigos, ele se torna Hyper Knuckles, seu estágio de maior poder. Seu corpo se torna luminoso como as cores das esmeraldas e seus socos ficam com a força de um terremoto, destruindo tudo por sua volta.

Mecha Sonic foi a invenção mais perfeita que Eggman pode criar para derrotar Sonic. Este robô possui uma inteligencia excepcional, sendo capaz até de pilotar as máquinas que Eggman já usou antigamente. Seu saltos alcançam alturas inimagináveis e sua velocidade é fantástica.

Porém, com tal inteligência, Mecha Sonic 3 até planejou e roubou a Master Emerald debaixo dos olhos de Knuckles. Com o poder da Esmeralda Mestre, Mecha Sonic utilizou-se do seu poder para se tornar a maquina perfeita. Suas perigosas esferas de energia são letais. Porém, ele possui uma fraqueza: por ser uma máquina e não um ser vivo, o poder da Esmeralda permanece por pouquíssimo tempo, tornando-o vulnerável.